RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARL2	P36404	184 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NRIP1	P48552	1158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAB27A	P51159	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTEN	P60484	403 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERVFC1	P60507	584 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRT17	Q04695	432 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBE3A	Q05086	875 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAPS	Q13938	189 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TLE6	Q9H808	572 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PER2	O15055	1255 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CA8	P35219	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LTBR	P36941	435 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NDUFV1	P49821	464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	IER5L	Q5T953	404 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TSPAN1	O60635	241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF623	O75123	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	OFD1	O75665	1012 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPM1A	P35813	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	BCAR1	P56945	870 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TCF15	Q12870	199 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADAM15	Q13444	863 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ECM1	Q16610	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBX10	O75333	385 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ITGA4	P13612	1032 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LIG1	P18858	919 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDC25A	P30304	524 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	AXL	P30530	894 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDIA5	Q14554	519 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LAD1	O00515	517 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	FSCN2	O14926	492 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	B4GALT5	O43286	388 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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