RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL5Q96PQ7 755 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 RSAD1Q9HA92 442 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCN4P51793 760 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR149Q86SP6 731 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CNPP09543 421 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM20AQ96MK3 541 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRB3O75022 631 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 POMCP01189 267 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRC2P26717 231 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM175Q9BSA9 504 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND4AQ7Z401 1863 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE4A6NLX3 237 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 NRP1O14786 923 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 RFC5P40937 340 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC149Q6ZUS6 474 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK8Q86SG6 692 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 HAS1Q92839 578 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 LXNQ9BS40 222 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FAN1Q9Y2M0 1017 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PPME1Q9Y570 386 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH2P05091 517 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 YWHABP31946 246 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC2Q15006 297 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf19Q8IY42 314 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF149Q8NC42 400 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD1Q9H3U5 465 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH5Q9NX47 278 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 RGL1Q9NZL6 768 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 KANSL3Q9P2N6 904 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 STK39Q9UEW8 545 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PLXNA3P51805 1871 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1HO95180 2353 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PROB1E7EW31 1015 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DTNBO60941 627 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 NCLP19338 710 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA7Q15375 998 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
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CAPNS1-211ENST00000590874 OXER1Q8TDS5 423 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD2LO14523 706 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB39O15060 712 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SCRN1Q12765 414 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ASCL5Q7RTU5 278 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FERMT3Q86UX7 667 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX3O15119 743 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SOD2P04179 222 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAPH2Q6IBW4 605 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEDQ86YR6 584 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP11Q8WWU5 503 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 DYDC2Q96IM9 177 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF39Q9H2S5 420 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 IPPQ9Y573 584 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-211ENST00000590874 URODP06132 367 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCN5P51795 746 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4A11Q02928 519 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 XKR9Q5GH70 373 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 COLGALT2Q8IYK4 626 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FLCNQ8NFG4 579 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN1C1Q9NR34 630 aa28.61■■■□□ 2.17
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