RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589772.1

CNP-208, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 4

Gene CNP, Length 516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-208ENST00000589772 HYAL1Q12794 435 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NOTUMQ6P988 496 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 GBP3Q9H0R5 595 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RNF39Q9H2S5 420 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CLDND1Q9NY35 253 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 HES2Q9Y543 173 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 IPPQ9Y573 584 aa14.63□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ITGA4P13612 1032 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 BCAR1P56945 870 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ERVFC1P60507 584 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 DEPTORQ8TB45 409 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PNMA5Q96PV4 448 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 APOL6Q9BWW8 343 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CSRNP2Q9H175 543 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RSAD1Q9HA92 442 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TLR9Q9NR96 1032 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SPG21Q9NZD8 308 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 USP20Q9Y2K6 914 aa14.62□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 A0A1B0GUA9 196 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NPTXRO95502 500 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NAMPTP43490 491 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NRIP1P48552 1158 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PLCB3Q01970 1234 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 KRT17Q04695 432 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 UBE3AQ05086 875 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 GRIN1Q05586 938 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RESTQ13127 1097 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PPP2R5AQ15172 486 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CABP7Q86V35 215 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 URGCPQ8TCY9 931 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 KIFAP3Q92845 792 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SNX21Q969T3 373 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CCDC51Q96ER9 411 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 IFT74Q96LB3 600 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 FZD8Q9H461 694 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CLIC4Q9Y696 253 aa14.61□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SFI1A8K8P3 1242 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PER2O15055 1255 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 LINC01565O15544 149 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 B4GALT3O60512 393 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 HIP1RO75146 1068 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 BMP15O95972 392 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 POMCP01189 267 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PPM1AP35813 382 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 LTBRP36941 435 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 COL19A1Q14993 1142 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 MAPK6Q16659 721 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 HYIQ5T013 277 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 CNNM3Q8NE01 707 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNP-208ENST00000589772 GAD1Q99259 594 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms