RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 FIZ1Q96SL8 496 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 UBE4BO95155 1302 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 DENND3A2RUS2 1198 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 RHOBTB3O94955 611 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 GCNT3O95395 438 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ACTN1P12814 892 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 SCP2P22307 547 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ABCD1P33897 745 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 EFNA5P52803 228 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ALCAMQ13740 583 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 LPIN1Q14693 890 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 RAB30Q15771 203 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 FAM228AQ86W67 206 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 SPATA20Q8TB22 786 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 KCNN1Q92952 543 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 HPS3Q969F9 1004 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 HVCN1Q96D96 273 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 GSDMAQ96QA5 445 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MSRAQ9UJ68 235 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 SQORQ9Y6N5 450 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MYO7AQ13402 2215 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 NBNO60934 754 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 RPS6KA5O75582 802 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PPP1R37O75864 691 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ERLIN2O94905 339 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PRKCBP05771 671 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MYBP10242 640 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MYOGP15173 224 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CASP5P51878 434 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PAK2Q13177 524 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PSMD2Q13200 908 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MAPK6Q16659 721 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 USP38Q8NB14 1042 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 BRWD1Q9NSI6 2320 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 K7ERI5 159 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CXCL10P02778 98 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 FGFR4P22455 802 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 CD52P31358 61 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 GTF2BQ00403 316 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 STRN3Q13033 797 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 FAM187BQ17R55 369 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TCTN1Q2MV58 587 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 FZD8Q9H461 694 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-204ENST00000587769 GDAQ9Y2T3 454 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.5 ms