RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ADAM2	Q99965	735 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	MGEA5	O60502	916 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	AMH	P03971	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	GTF2B	Q00403	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	EHHADH	Q08426	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CUL4B	Q13620	913 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ALCAM	Q13740	583 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1B0GUA9	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900		C9IYK1	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900		K7ENM7	598 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	KLRC4	O43908	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	SKI	P12755	728 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	RAB27A	P51159	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	DPYD	Q12882	1025 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	STRN3	Q13033	797 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	COASY	Q13057	564 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	N4BP3	O15049	544 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF623	O75123	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R37	O75864	691 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	EOMES	O95936	686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CASP1	P29466	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	DEFB103A	P81534	67 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	PSMD2	Q13200	908 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	POSTN	Q15063	836 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	B4GALT5	O43286	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	GJB5	O95377	273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	PIGR	P01833	764 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	EDN1	P05305	212 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	KCNB1	Q14721	858 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-208	ENST00000586900	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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