RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	PIGR	P01833	764 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PRKCB	P05771	671 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	CD52	P31358	61 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	SMTN	P53814	917 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	CCL23	P55773	120 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PSMD2	Q13200	908 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	ALCAM	Q13740	583 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	MED15	Q96RN5	788 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.85	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667		H0YCG3	227 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	ACKR2	O00590	384 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	SCP2	P22307	547 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PROZ	P22891	400 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PRCP	P42785	496 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DNMT1-208	ENST00000586667	MGEA5	O60502	916 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ADSS	P30520	456 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NLRP12	P59046	1061 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TYRO3	Q06418	890 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	DSC3	Q14574	896 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MAPK6	Q16659	721 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667		K7ERI5	159 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM189A1	O60320	539 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	EVI5	O60447	810 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CSF2RA	P15509	400 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	RAG1	P15918	1043 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	RFC2	P35250	354 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	RGS19	P49795	217 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	EPHB4	P54760	987 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PAK2	Q13177	524 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1B0GUA9	196 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	SYN1	P17600	705 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ABCD1	P33897	745 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	STX1A	Q16623	288 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	BAD	Q92934	168 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DNMT1-208	ENST00000586667	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.81	□□□□□ -0.2

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