RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLPP4Q5VZY2 271 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADHFE1Q8IWW8 467 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KIF3AQ9Y496 699 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C19orf67A6NJJ6 358 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMC7Q7Z402 723 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMRP1Q8NCR6 262 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CNNM3Q8NE01 707 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCDC51Q96ER9 411 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HIDE1A8MVS5 230 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PI4K2BG5E9Z4 385 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MUTP22033 750 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCNC3Q14003 757 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NBR1Q14596 966 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AMHR2Q16671 573 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NOTUMQ6P988 496 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POTEGQ6S5H5 508 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 VN1R2Q8NFZ6 395 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM169Q96HH4 297 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMX3Q96JJ7 454 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RSAD1Q9HA92 442 aa26.77■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GALTP07902 379 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 URGCPQ8TCY9 931 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UBN1Q9NPG3 1134 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PDIA5Q14554 519 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IGSF21Q96ID5 467 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CPB2Q96IY4 423 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CSRNP2Q9H175 543 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IPPQ9Y573 584 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PTGDRQ13258 359 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF280BQ86YH2 543 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DNAJB4Q9UDY4 337 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 B4GALT3O60512 393 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SRGAP2BP0DMP2 458 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ITGA4P13612 1032 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MCM2P49736 904 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PADI6Q6TGC4 694 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GBP3Q9H0R5 595 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LAD1O00515 517 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 INPPL1O15357 1258 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DDHD2O94830 711 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CYP11B2P19099 503 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC11A1P49279 550 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ECM1Q16610 540 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 VPS52Q8N1B4 723 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZBP1Q9H171 429 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RNF39Q9H2S5 420 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 STK24Q9Y6E0 443 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 B4GALT5O43286 388 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RAB34Q9BZG1 259 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IRAK3Q9Y616 596 aa26.71■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 A0A1B0GUA9 196 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GPR37L1O60883 481 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms