RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SARSP49591 514 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KRBA2Q6ZNG9 492 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 HERC6Q8IVU3 1022 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNNM3Q8NE01 707 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNN1Q92952 543 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 GBP4Q96PP9 640 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 PANK4Q9NVE7 773 aa36.47■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC17A8Q8NDX2 589 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENGASEQ8NFI3 743 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 FIZ1Q96SL8 496 aa36.46■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ASIC1P78348 528 aa36.45■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC34Q96HJ3 373 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPB2Q96IY4 423 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 BLZF1Q9H2G9 400 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 OLFML3Q9NRN5 406 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRXCR1A8MXD5 290 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCD1P33897 745 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM189BP81408 668 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NPAS4Q8IUM7 802 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRIPAKQ8N1N5 446 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GUA9 196 aa36.43■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STAG3L1P0CL83 205 aa36.43■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CUL4BQ13620 913 aa36.43■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa36.43■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KANK3Q6NY19 840 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC13DQ70J99 1090 aa36.42■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM105AQ9NUU6 356 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 COASYQ13057 564 aa36.41■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa36.41■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF720Q7Z2F6 126 aa36.4■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PBX4Q9BYU1 374 aa36.39■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF623O75123 536 aa36.39■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 INSL6Q9Y581 213 aa36.39■■■■□ 3.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa36.39■■■■□ 3.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NT5DC1Q5TFE4 455 aa36.38■■■■□ 3.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATF7IP2Q5U623 682 aa36.38■■■■□ 3.41
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