RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 A0A087WWV3 80 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 B4GALT3O60512 393 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 CXCL14O95715 111 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 PTENP60484 403 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 ZBP1Q9H171 429 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 RSAD1Q9HA92 442 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 POTEMA6NI47 508 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 DGAT1O75907 488 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 MCM7P33993 719 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 SLC11A1P49279 550 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 RARRES1P49788 294 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 ASAP3Q8TDY4 903 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 AUTS2Q8WXX7 1259 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 CASP10Q92851 521 aa28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 CARNS1A5YM72 827 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 TSPAN1O60635 241 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 DDHD2O94830 711 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 ERLIN2O94905 339 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 ARL2P36404 184 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CAPSQ13938 189 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 URGCPQ8TCY9 931 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 NCLP19338 710 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 TFDP1Q14186 410 aa28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CPB2Q96IY4 423 aa28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 C8orf76Q96K31 380 aa28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CTSAP10619 480 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 AXLP30530 894 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 POU5F1BQ06416 359 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.124e-9■■■■■ 33.7
SPNS1-209ENST00000567771 EDAQ92838 391 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 VN1R3Q9BXE9 311 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CDH22Q9UJ99 828 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 IRAK3Q9Y616 596 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 POMCP01189 267 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 ITGA4P13612 1032 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 GLRA2P23416 452 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 MBTD1Q05BQ5 628 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 AMHR2Q16671 573 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CNNM3Q8NE01 707 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 RNF39Q9H2S5 420 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 KANSL3Q9P2N6 904 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 IPPQ9Y573 584 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 USO1O60763 962 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF174Q15697 407 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 NOTUMQ6P988 496 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 HFE2Q6ZVN8 426 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 KIF2CQ99661 725 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 HES2Q9Y543 173 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 MED24O75448 989 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 ALDH2P05091 517 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 MAEAQ7L5Y9 396 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC51Q96ER9 411 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM175Q9BSA9 504 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 CSRNP2Q9H175 543 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 TUFT1Q9NNX1 390 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 UBN1Q9NPG3 1134 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 GPRC5CQ9NQ84 441 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 FAN1Q9Y2M0 1017 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-209ENST00000567771 NRP1O14786 923 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 GIT2Q14161 759 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 NFKBIZQ9BYH8 718 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 ADAM7Q9H2U9 754 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 B4GALT5O43286 388 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 EPCAMP16422 314 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 PTPN14Q15678 1187 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 GAD1Q99259 594 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 TECTAO75443 2155 aa28.24■■■□□ 2.11
SPNS1-209ENST00000567771 ARL5CA6NH57 179 aa28.24■■■□□ 2.11
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