RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566376.3

TCF4-233, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 462 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-233	ENST00000566376	BAIAP3	O94812	1187 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	GJB5	O95377	273 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	TDP2	O95551	362 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	INSRR	P14616	1297 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	FOSL2	P15408	326 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	AK2	P54819	239 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	TRAF1	Q13077	416 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	STK3	Q13188	491 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	BFSP2	Q13515	415 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	LPIN1	Q14693	890 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	GRIK4	Q16099	956 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	ME3	Q16798	604 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	RPAIN	Q86UA6	219 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	CERS4	Q9HA82	394 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	LINC01553	A4QN01	128 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	TMEM150B	A6NC51	233 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	EML1	O00423	815 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	MSH4	O15457	936 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	MGEA5	O60502	916 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	PFKFB2	O60825	505 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	RHOQ	P17081	205 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	THPO	P40225	353 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	PPFIA1	Q13136	1202 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	RAB30	Q15771	203 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	TMX1	Q9H3N1	280 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	DMD	P11532	3685 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-233	ENST00000566376	NOTCH4	Q99466	2003 aa		7.34	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	NRCAM	Q92823	1304 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	JAK2	O60674	1132 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	PSMD10	O75832	226 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	C22orf31	O95567	290 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	RSPH10B	P0C881	870 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	GHR	P10912	638 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	MX2	P20592	715 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	CHRNA4	P43681	627 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	GRB10	Q13322	594 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	DRP2	Q13474	957 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	C16orf46	Q6P387	395 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	NECAB1	Q8N987	351 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	TBCK	Q8TEA7	893 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	SLC5A5	Q92911	643 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	GTF3C6	Q969F1	213 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	CDHR1	Q96JP9	859 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-233	ENST00000566376	OBSL1	O75147	1896 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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