RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	DGAT1	O75907	488 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CASP10	Q92851	521 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	IGSF21	Q96ID5	467 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	LYPLA2	O95372	231 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	GALT	P07902	379 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ITGA4	P13612	1032 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	PLA2G5	P39877	138 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CPB2	Q96IY4	423 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	MTMR9	Q96QG7	549 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	POMC	P01189	267 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC11A1	P49279	550 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	PTEN	P60484	403 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF174	Q15697	407 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	UBXN11	Q5T124	520 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	NOTUM	Q6P988	496 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	APOL6	Q9BWW8	343 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPAN1	O60635	241 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	RARRES1	P49788	294 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CAPS	Q13938	189 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CES5A	Q6NT32	575 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CNNM3	Q8NE01	707 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ERMN	Q8TAM6	284 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBP1	Q9H171	429 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ALDH2	P05091	517 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	AXL	P30530	894 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNC3	Q14003	757 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	SUSD6	Q92537	303 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	IPP	Q9Y573	584 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	DDHD2	O94830	711 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ARL2	P36404	184 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC51	Q96ER9	411 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	S1PR5	Q9H228	398 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	B4GALT3	O60512	393 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	OR52Z1	P0C646	297 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	CTSA	P10619	480 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	GLRA2	P23416	452 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	GIT2	Q14161	759 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB33	Q86T24	672 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	HACE1	Q8IYU2	909 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	HES2	Q9Y543	173 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	MED24	O75448	989 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	MLH1	P40692	756 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	OR1G1	P47890	313 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC38	Q5R3I4	469 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	EDA	Q92838	391 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4C-208	ENST00000564966	NACC1	Q96RE7	527 aa		28.12	■■■□□ 2.09

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