RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	USP38	Q8NB14	1042 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	RNF169	Q8NCN4	708 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	GPT2	Q8TD30	523 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	BICD1	Q96G01	975 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	FIZ1	Q96SL8	496 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ADAM2	Q99965	735 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	EXOC1	Q9NV70	894 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744		K7ERI5	159 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ENPP3	O14638	875 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	NPTXR	O95502	500 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ANK1	P16157	1881 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	MCM4	P33991	863 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	KCNJ6	P48051	423 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	GATM	P50440	423 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	SMTN	P53814	917 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	DPYD	Q12882	1025 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	DSC3	Q14574	896 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	MAPK6	Q16659	721 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ISM2	Q6H9L7	571 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB33	Q86T24	672 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	HERVK_113	Q902F9	699 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	APBB2	Q92870	758 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	APOL6	Q9BWW8	343 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	FZD8	Q9H461	694 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TISP43	B9A030	160 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	BIN1	O00499	593 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	AMH	P03971	560 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	EFNA5	P52803	228 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	RABGGTB	P53611	331 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	POU5F1B	Q06416	359 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	KCNA1	Q09470	495 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	STRN3	Q13033	797 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	UBXN11	Q5T124	520 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	KANK3	Q6NY19	840 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	LPP	Q93052	612 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TIGD1	Q96MW7	591 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	TBX20	Q9UMR3	447 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	GDA	Q9Y2T3	454 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RPL4-208	ENST00000564744	COL4A6	Q14031	1691 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	ACKR2	O00590	384 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	N4BP3	O15049	544 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R37	O75864	691 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	BAIAP3	O94812	1187 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	FGFR1	P11362	822 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	MYOG	P15173	224 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RPL4-208	ENST00000564744	BMP8B	P34820	402 aa		9.33	□□□□□ -0.92

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