RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	APPBP2	Q92624	585 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TCF25	Q9BQ70	676 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM24	O15164	1050 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MFAP3L	O75121	409 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	LAG3	P18627	525 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K12	Q12852	859 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GAGE13	Q4V321	117 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C4orf46	Q504U0	113 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	HOMER1	Q86YM7	354 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PGBD4	Q96DM1	585 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GBP4	Q96PP9	640 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RSAD1	Q9HA92	442 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	IL23A	Q9NPF7	189 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SYBU	Q9NX95	663 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB1	Q9Y576	335 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC12A8	A0AV02	714 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2QL1	A1L167	161 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF3B	O15066	747 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXP2	O15409	715 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MAFG	O15525	162 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	AVPR1B	P47901	424 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RHBDL3	P58872	404 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	BIRC2	Q13490	618 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ACAP1	Q15027	740 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM177	Q53S58	311 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf27A	Q580R0	203 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ODR4	Q5SWX8	454 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRB2	Q8N423	598 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	JDP2	Q8WYK2	163 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MAF1	Q9H063	256 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM260	Q9NX78	707 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF7	Q9UBF6	113 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	DVL2	O14641	736 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RECQL4	O94761	1208 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	NPTXR	O95502	500 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MASP1	P48740	699 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GYS2	P54840	703 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	BPIFB4	P59827	614 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF9	Q00978	393 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE4A	Q14139	1066 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	MB21D1	Q8N884	522 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF366	Q8N895	744 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	HIPK4	Q8NE63	616 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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