RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 LRRC15Q8TF66 581 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 RNF39Q9H2S5 420 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 AAASQ9NRG9 546 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 DNM3Q9UQ16 869 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 BMP1P13497 986 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 AXLP30530 894 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 NOTUMQ6P988 496 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 PLIN2Q99541 437 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CSRNP2Q9H175 543 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 FZD8Q9H461 694 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 USP20Q9Y2K6 914 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 HES2Q9Y543 173 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 IPPQ9Y573 584 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CLIC4Q9Y696 253 aa23.11■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 MAPK7Q13164 816 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 PTPAQ15257 358 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CCDC51Q96ER9 411 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ZNF558Q96NG5 402 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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CS-222ENST00000550996 KCNA5P22460 613 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 NAMPTP43490 491 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ERVFC1P60507 584 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 PGBD4Q96DM1 585 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GUA9 196 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 FSCN2O14926 492 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 BMP15O95972 392 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 BCAR1P56945 870 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 PLCB3Q01970 1234 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 UBE3AQ05086 875 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 FAM187BQ17R55 369 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 CABP7Q86V35 215 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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CS-222ENST00000550996 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.08■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.07■■□□□ 1.28
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CS-222ENST00000550996 HIP1RO75146 1068 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 LTBRP36941 435 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SLC12A3P55017 1021 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 AAK1Q2M2I8 961 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 AK8Q96MA6 479 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 TLR9Q9NR96 1032 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SPG21Q9NZD8 308 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 LZTS1Q9Y250 596 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 STX6O43752 255 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NPTXRO95502 500 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PRKCBP05771 671 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PPM1AP35813 382 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PPP2R5AQ15172 486 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 DEPTORQ8TB45 409 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 INPPL1O15357 1258 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 DDHD2O94830 711 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ITGA4P13612 1032 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NPTX2P47972 431 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SLC11A1P49279 550 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 MAPK6Q16659 721 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 USP49Q70CQ1 688 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 HSCBQ8IWL3 235 aa23.05■■□□□ 1.28
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