RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	NELFA	Q9H3P2	528 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MSL2	Q9HCI7	577 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125		K7ESM1	405 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MTNR1B	P49286	362 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	UBE3C	Q15386	1083 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	GPR135	Q8IZ08	494 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	TNKS	O95271	1327 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2QL1	A1L167	161 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	KLHL33	A6NCF5	533 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MTSS1	O43312	755 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	PDGFRB	P09619	1106 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	RBP3	P10745	1247 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	AGXT	P21549	392 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	GRM7	Q14831	915 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ADRM1	Q16186	407 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ANO4	Q32M45	955 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	PPM1N	Q8N819	430 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	CHST13	Q8NET6	341 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	IL23A	Q9NPF7	189 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	TLR9	Q9NR96	1032 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	RPTOR	Q8N122	1335 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	NRP1	O14786	923 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	FOXS1	O43638	330 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	AKR1B10	O60218	316 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM127	O75204	238 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	CTSS	P25774	331 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	NPEPPS	P55786	919 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ADAM8	P78325	824 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	DUSP2	Q05923	314 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	FUK	Q8N0W3	1084 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ARL8A	Q96BM9	186 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	TCF25	Q9BQ70	676 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ADI1	Q9BV57	179 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	GREM2	Q9H772	168 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-231	ENST00000544125	PHF2	O75151	1096 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	RAD17	O75943	681 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	CASR	P41180	1078 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	WNT3A	P56704	352 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	MALL	Q13021	153 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	DUSP8	Q13202	625 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	GPR156	Q8NFN8	814 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	JADE3	Q92613	823 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	SAMD11	Q96NU1	681 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	EPC1	Q9H2F5	836 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	DEF6	Q9H4E7	631 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	DNM3	Q9UQ16	869 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	PATE3	B3GLJ2	98 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHGA12	O60330	932 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF623	O75123	536 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	GYPE	P15421	78 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	ICAM4	Q14773	271 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	NOMO1	Q15155	1222 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	HS1BP3	Q53T59	392 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-231	ENST00000544125	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.01	□□□□□ -1.45

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