RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 E9PMD0 336 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 N4BP3O15049 544 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 ITGA4P13612 1032 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 GUCY2CP25092 1073 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 CDC25AP30304 524 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 PLCB3Q01970 1234 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 TJAP1Q5JTD0 557 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 FZD8Q9H461 694 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 CWH43Q9H720 699 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 RSAD1Q9HA92 442 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX3-202ENST00000539804 A0A1B0GUA9 196 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 H0YCG3 227 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SMTNP53814 917 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SPPL3Q8TCT6 385 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 RNF19AQ9NV58 838 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SPG21Q9NZD8 308 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ACKR2O00590 384 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 GRM6O15303 877 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 FGF18O76093 207 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ITGB1P05556 798 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PRKCBP05771 671 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PLA2G4BP0C869 781 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ABCD1P33897 745 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 AMHR2Q16671 573 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 POF1BQ8WVV4 589 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ASB2Q96Q27 587 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 TMEM134Q9H6X4 195 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 TLR9Q9NR96 1032 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 IPPQ9Y573 584 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 K7ERI5 159 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 HIP1RO75146 1068 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 NR1I2O75469 434 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 OFD1O75665 1012 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 UBXN11Q5T124 520 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ATL3Q6DD88 541 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 CPB2Q96IY4 423 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PNMA5Q96PV4 448 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 CLIC4Q9Y696 253 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 CCDC169A6NNP5 214 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SLC39A14Q15043 492 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PTPAQ15257 358 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 LPPQ93052 612 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 TMEM169Q96HH4 297 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 KMT5AQ9NQR1 393 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SLC12A3P55017 1021 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 SPIRE2Q8WWL2 714 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 STK17AQ9UEE5 414 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 FAM50BQ9Y247 325 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-202ENST00000539804 INPPL1O15357 1258 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-202ENST00000539804 PEX3P56589 373 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-202ENST00000539804 GIT2Q14161 759 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-202ENST00000539804 STK38Q15208 465 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-202ENST00000539804 BSNDQ8WZ55 320 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-202ENST00000539804 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PITX3-202ENST00000539804 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-202ENST00000539804 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms