RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266		A0A1W2PRG0	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266		C9IYK1	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266		F5H6K3	240 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PDHX	O00330	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FLOT1	O75955	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	DDAH1	O94760	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	NDUFB10	O96000	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CALM1	P0DP23	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CALM2	P0DP24	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CALM3	P0DP25	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CD8B	P10966	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CD96	P40200	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	NEK4	P51957	841 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ANTXR2	P58335	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	KLRC3	Q07444	240 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	RABEP1	Q15276	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	MKL1	Q969V6	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ZBTB43	O43298	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CA12	O43570	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	PDHB	P11177	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SRF	P11831	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CPA1	P15085	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	LIFR	P42702	1097 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TM4SF4	P48230	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	STAT2	P52630	851 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	RCAN1	P53805	252 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	COG2	Q14746	738 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SEC23A	Q15436	765 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266		Q6ZUG5	572 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266		Q8N3U1	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG1-208	ENST00000538266	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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