RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	CALM2	P0DP24	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CALM3	P0DP25	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CD72	P21854	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PRR16	Q569H4	304 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NELL1	Q92832	810 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SLC27A2	O14975	620 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CDC27	P30260	824 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NTHL1	P78549	312 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	MSH4	O15457	936 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	TGM5	O43548	720 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	LILRB5	O75023	590 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GLUD1	P00367	558 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	FZD5	Q13467	585 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	POTEH	Q6S545	545 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	STAM	Q92783	540 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CHMP2A	O43633	222 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	UROD	P06132	367 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ADRB1	P08588	477 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CIITA	P33076	1130 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	DSG1	Q02413	1049 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ATRX	P46100	2492 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ADH1A	P07327	375 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SKI	P12755	728 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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