RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526458.1

C9orf135-AS1-203, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MEIS3P2A8K0S8 358 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HIDE1A8MVS5 230 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PRR33A8MZF0 331 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 OFD1O75665 1012 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 OR52Z1P0C646 297 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ATP2B1P20020 1258 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PTENP60484 403 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KCNC3Q14003 757 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VN1R2Q8NFZ6 395 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ERMNQ8TAM6 284 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CCDC51Q96ER9 411 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NFKBIZQ9BYH8 718 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TUFT1Q9NNX1 390 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 UBN1Q9NPG3 1134 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KANSL3Q9P2N6 904 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 STK39Q9UEW8 545 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PLXNA3P51805 1871 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TSPAN1O60635 241 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NCLP19338 710 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CA8P35219 290 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ARL2P36404 184 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TECP42680 631 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CAPSQ13938 189 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GIT2Q14161 759 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 UBXN11Q5T124 520 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HAUS3Q68CZ6 603 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ANKRD54Q6NXT1 300 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PIGOQ8TEQ8 1089 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CASP10Q92851 521 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IGSF21Q96ID5 467 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KIF2CQ99661 725 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GBP3Q9H0R5 595 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZBP1Q9H171 429 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TRIP11Q15643 1979 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 C2orf71A6NGG8 1288 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GALTP07902 379 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ITGA4P13612 1032 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TRAPPC10P48553 1259 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RBM10P98175 930 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MBTD1Q05BQ5 628 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TTC38Q5R3I4 469 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LLGL2Q6P1M3 1020 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CATSPER3Q86XQ3 398 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VPS52Q8N1B4 723 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MCPH1Q8NEM0 835 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ASAP3Q8TDY4 903 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SUSD6Q92537 303 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CSRNP2Q9H175 543 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DNAJB4Q9UDY4 337 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IPPQ9Y573 584 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IRAK3Q9Y616 596 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LOC730098B7Z3J9 87 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ST18O60284 1047 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MED24O75448 989 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CTSAP10619 480 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MUTP22033 750 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GLRA2P23416 452 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RPA1P27694 616 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC11A1P49279 550 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RABEP1Q15276 862 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF174Q15697 407 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF280BQ86YH2 543 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RNF135Q8IUD6 432 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms