RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 MAP7D2Q96T17 732 aa16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 KIF20AO95235 890 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 PRKCBP05771 671 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R2P41236 205 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 KLK7P49862 253 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 PTENP60484 403 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 STRN3Q13033 797 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 SARM1Q6SZW1 724 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.98■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 PPME1Q9Y570 386 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 PTGISQ16647 500 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 MIIPQ5JXC2 388 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.98■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 ZNF333Q96JL9 665 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM206Q9H813 350 aa16.98■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 UBE4BO95155 1302 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 CETN3O15182 167 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 EXOC3O60645 756 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 ADRB2P07550 413 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 ACOT2P49753 483 aa16.97■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 DLG4P78352 724 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 APBA1Q02410 837 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 CEP120Q8N960 986 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 N4BP3O15049 544 aa16.96■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 TRIM49CP0CI26 452 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 OSTNP61366 133 aa16.96■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 DMAC2Q9NW81 257 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 B4GALT4O60513 344 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 TNFSF9P41273 254 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 TFDP1Q14186 410 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 AMHR2Q16671 573 aa16.96■□□□□ 0.31
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.96■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
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TRPS1-206ENST00000517323 THPOP40225 353 aa16.95■□□□□ 0.3
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TRPS1-206ENST00000517323 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
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TRPS1-206ENST00000517323 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.95■□□□□ 0.3
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TRPS1-206ENST00000517323 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 FZD8Q9H461 694 aa16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 223.6
TRPS1-206ENST00000517323 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 NR1I3Q14994 352 aa16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TRPS1-206ENST00000517323 TMC6Q7Z403 805 aa16.95■□□□□ 0.3
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