RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 STILQ15468 1287 aa18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ZBBXA8MT70 800 aa18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CSPG5O95196 566 aa18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ADCY2Q08462 1091 aa18.62■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SATB1Q01826 763 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 NAA25Q14CX7 972 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SCFD2Q8WU76 684 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TXNDC9O14530 226 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PGBD4Q96DM1 585 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 HAUS8Q9BT25 410 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 DPYSL4O14531 572 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 VEPH1Q14D04 833 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 RDM1Q8NG50 284 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 GYS1P13807 737 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.61■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SOX5P35711 763 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 NUP85Q9BW27 656 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 FTLP02792 175 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TRIM49P0CI25 452 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TRIM49CP0CI26 452 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ANTXR2P58335 489 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 EFHC2Q5JST6 749 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 RGL2O15211 777 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 NNMTP40261 264 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TTC26A0AVF1 554 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CCL15Q16663 113 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 IER5Q5VY09 327 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.6■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PLS3P13797 630 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CFAP36Q96G28 342 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 APOEP02649 317 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 KBTBD13C9JR72 458 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 RHOBTB3O94955 611 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TGFB2P61812 414 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 RBP5P82980 135 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TTC4O95801 387 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD40Q6AI12 368 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 RFFLQ8WZ73 363 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 BNIP3LO60238 219 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 CA4P22748 312 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 PDXDC1Q6P996 788 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 DCLK2Q8N568 766 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.58■□□□□ 0.57
PTDSS1-202ENST00000517309 HUNKP57058 714 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 PARVAQ9NVD7 372 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 KRT38O76015 456 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 CHEK2O96017 543 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 CPB1P15086 417 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 SREBF2Q12772 1141 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 GANCQ8TET4 914 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 LRGUKQ96M69 825 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.58■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 GRID2IPA4D2P6 1211 aa18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 ADSSL1Q8N142 457 aa18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 Q9H521 79 aa18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.57■□□□□ 0.56
PTDSS1-202ENST00000517309 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms