RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 C1QL4Q86Z23 238 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 NXPE1Q8N323 547 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 OXSMQ9NWU1 459 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 BTBD7Q9P203 1132 aa8.03□□□□□ -1.12
PDE4D-225ENST00000515835 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
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PDE4D-225ENST00000515835 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 OCRLQ01968 901 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 PRR31Q5SQ13 230 aa8.02□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 ASB15Q8WXK1 588 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 SPC25Q9HBM1 224 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 NTMQ9P121 344 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 ASB1Q9Y576 335 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.02□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 KDRP35968 1356 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 EFHBQ8N7U6 833 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 GBP4Q96PP9 640 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.01□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 COL24A1Q17RW2 1714 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 CHGBP05060 677 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 IL13P35225 146 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 PASD1Q8IV76 773 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 INCENPQ9NQS7 918 aa8□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 CROTQ9UKG9 612 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.99□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 FBXO21O94952 628 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 KCND1Q9NSA2 647 aa7.98□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
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PDE4D-225ENST00000515835 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 ZEB2O60315 1214 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 IL18BPO95998 194 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 CPEP16870 476 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 CNGA1P29973 690 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 GLRBP48167 497 aa7.97□□□□□ -1.13
PDE4D-225ENST00000515835 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.97□□□□□ -1.13
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