RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PRELID1	Q9Y255	219 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PLAA	Q9Y263	795 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPY2	A6NKD2	308 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF213	O14771	459 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TTI1	O43156	1089 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MBD4	O95243	580 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PAH	P00439	452 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT1	P04264	644 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPY3	P0CV98	308 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPY8	P0CW00	308 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GART	P22102	1010 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MTHFR	P42898	656 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP2K3	P46734	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	DGKG	P49619	791 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CCT8	P50990	548 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ARPC4	P59998	168 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPY1	Q01534	308 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FAP	Q12884	760 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SP140	Q13342	867 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	IQCB1	Q15051	598 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	C5orf22	Q49AR2	442 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO30	Q8TB52	745 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF384	Q8TF68	577 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZWILCH	Q9H900	591 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TMX2	Q9Y320	296 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CLRN2	A0PK11	232 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ABLIM1	O14639	778 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBTB43	O43298	467 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX4	O95219	450 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TPM1	P09493	284 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GZMA	P12544	262 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	HSD3B1	P14060	373 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MUT	P22033	750 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PRKAR1B	P31321	381 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	GALNS	P34059	522 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX5	P35711	763 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ITIH3	Q06033	890 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RUNX1T1	Q06455	604 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TCEA2	Q15560	299 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CCNG2	Q16589	344 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC14	Q49A88	953 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SBK1	Q52WX2	424 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	PASD1	Q8IV76	773 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NCOA7	Q8NI08	942 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	CENPO	Q9BU64	300 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NAPB	Q9H115	298 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	OGFR	Q9NZT2	677 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
FBXO38-208	ENST00000504971	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		7.35	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms