RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 CLIC6Q96NY7 704 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CCDC169A6NNP5 214 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PRKCBP05771 671 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 LAG3P18627 525 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 GUCY2CP25092 1073 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TXLNAP40222 546 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 SLC12A3P55017 1021 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PEX3P56589 373 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CNNM3Q8NE01 707 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 FZD8Q9H461 694 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 CWH43Q9H720 699 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 KCND2Q9NZV8 630 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-202ENST00000502676 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 GRM6O15303 877 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 EFNA5P52803 228 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 PKP1Q13835 747 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 BECN1Q14457 450 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 FAM187BQ17R55 369 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 USP49Q70CQ1 688 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 DAW1Q8N136 415 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 KLHL23Q8NBE8 558 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 ITGA4P13612 1032 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 LMAN2LQ9H0V9 348 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 RSAD1Q9HA92 442 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 IPPQ9Y573 584 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 A0A1B0GUA9 196 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 SFI1A8K8P3 1242 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 SPTLC2O15270 562 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 CSPG5O95196 566 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 ITGB1P05556 798 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 NPTX2P47972 431 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 MAPK7Q13164 816 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 MCM6Q14566 821 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 GPBP1Q86WP2 473 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 HACE1Q8IYU2 909 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 RAD54LQ92698 747 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 KIAA1671Q9BY89 1806 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 K7ERI5 159 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 ACKR2O00590 384 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 OFD1O75665 1012 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 NPTXRO95502 500 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 URGCPQ8TCY9 931 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 LRRC15Q8TF66 581 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 ZNF558Q96NG5 402 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 APOL6Q9BWW8 343 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 N4BP3O15049 544 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 YEATS4O95619 227 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-202ENST00000502676 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms