RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 MAF1Q9H063 256 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 BTBD7Q9P203 1132 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 RGS13O14921 159 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 LRIG2O94898 1065 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SLC25A27O95847 323 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 KIF5BP33176 963 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 STK3Q13188 491 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 KIF22Q14807 665 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 FANCBQ8NB91 859 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 FOXQ1Q9C009 403 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 MROH8Q9H579 483 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SRRDQ9UH36 339 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PNMA2Q9UL42 364 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF536O15090 1300 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM232C9JQI7 657 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 KLRF2D3W0D1 207 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PFKFB2O60825 505 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GJB6O95452 261 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 LARGE1O95461 756 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 HOXD10P28358 340 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SLC16A2P36021 539 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CCNFP41002 786 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PSMC4P43686 418 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GNAQP50148 359 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GRB14Q14449 540 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PPP2R5BQ15173 497 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 ME3Q16798 604 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 MTMR8Q96EF0 704 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 MYRFLQ96LU7 910 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PORCNQ9H237 461 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GJD2Q9UKL4 321 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PARP14Q460N5 1801 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 STRNO43815 780 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 UBOX5O94941 541 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 ICAM1P05362 532 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 NFICP08651 508 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SMARCA1P28370 1054 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GHRHRQ02643 423 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SCRN1Q12765 414 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TKFCQ3LXA3 575 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 VHLLQ6RSH7 139 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GPR142Q7Z601 462 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 NECAB1Q8N987 351 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 GTF3C6Q969F1 213 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 SNX21Q969T3 373 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 COA7Q96BR5 231 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TMX3Q96JJ7 454 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 APBA2Q99767 749 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 CPVLQ9H3G5 476 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 TRIM17Q9Y577 477 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-222ENST00000498801 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms