RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496085.1

UBE2C-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2C, Length 518 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-207ENST00000496085 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CWH43Q9H720 699 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CCDC169A6NNP5 214 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 GRM6O15303 877 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 OFD1O75665 1012 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 F13A1P00488 732 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PRKCBP05771 671 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 ITGA4P13612 1032 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PLCG1P19174 1290 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 NPTX2P47972 431 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PEX3P56589 373 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 STK38Q15208 465 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 SPECC1Q5M775 1068 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 HACE1Q8IYU2 909 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 DAW1Q8N136 415 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 URGCPQ8TCY9 931 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 EPSTI1Q96J88 318 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CLIC6Q96NY7 704 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 RSAD1Q9HA92 442 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 HCSTQ9UBK5 93 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 IPPQ9Y573 584 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 ACKR2O00590 384 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 N4BP3O15049 544 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 ITGB1P05556 798 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 LIG1P18858 919 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 MAPK7Q13164 816 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 RAD54LQ92698 747 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 ZNF558Q96NG5 402 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 THEGQ9P2T0 379 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 EYSQ5T1H1 3165 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CARNS1A5YM72 827 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 K7ERI5 159 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 SPTLC2O15270 562 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PPP6R2O75170 966 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 FGF18O76093 207 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 NPTXRO95502 500 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 YEATS4O95619 227 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PLS3P13797 630 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 DDIT3P35638 169 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PPM1AP35813 382 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 SMTNP53814 917 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 UBE3AQ05086 875 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PKP1Q13835 747 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 BECN1Q14457 450 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 MCM6Q14566 821 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 ARSHQ5FYA8 562 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 USP49Q70CQ1 688 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 GPBP1Q86WP2 473 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 POF1BQ8WVV4 589 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2C-207ENST00000496085 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms