RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.64■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TBC1D4O60343 1298 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SOD2P04179 222 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ALDH2P05091 517 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NAPAP54920 295 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TSSK4Q6SA08 328 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 URGCPQ8TCY9 931 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NELL1Q92832 810 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PHKBQ93100 1093 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 COL4A3Q01955 1670 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NRP1O14786 923 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SLC30A4O14863 429 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF862O60290 1169 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF623O75123 536 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CD72P21854 359 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ADCY7P51828 1080 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SPEM2Q0P670 501 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DRP2Q13474 957 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CASC1Q6TDU7 716 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PARM1Q6UWI2 310 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PALB2Q86YC2 1186 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FGF14Q92915 247 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM175Q9BSA9 504 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SPEGQ15772 3267 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC69A6NI79 296 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PAPLNO95428 1278 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 OATP04181 439 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 GLUD2P49448 558 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RAB27AP51159 221 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PRKCQQ04759 706 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 LPAL2Q16609 132 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NETO1Q8TDF5 533 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PGBD4Q96DM1 585 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SAMM50Q9Y512 469 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PATJQ8NI35 1801 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 A0A087WZ62 844 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PRC1O43663 620 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 POMCP01189 267 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CALM1P0DP23 149 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CALM2P0DP24 149 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CALM3P0DP25 149 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 KCNA4P22459 653 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FSHRP23945 695 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CHMLP26374 656 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 MAGEA9P43362 315 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PRKCEQ02156 737 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 DMWDQ09019 674 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 AP3B2Q13367 1082 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 AGMOQ6ZNB7 445 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TMTC2Q8N394 836 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 MARCH5Q9NX47 278 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 TGM5O43548 720 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 FANCBQ8NB91 859 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 CLDN23Q96B33 292 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 KANSL3Q9P2N6 904 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms