RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	OPTN	Q96CV9	577 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	VWCE	Q96DN2	955 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOOK2	Q96ED9	719 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	OTOF	Q9HC10	1997 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTBD18	B2RXH4	712 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPLX1	O14810	134 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEXI	O95424	95 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	EOMES	O95936	686 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCG2	P13521	617 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	YY1	P25490	414 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF5B	P33176	963 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADM	P35318	185 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK5R2	Q13319	367 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIL2	Q13356	520 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP2R5B	Q15173	497 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF43	Q68DV7	783 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOMER1	Q86YM7	354 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM192	Q8IY95	271 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIN3	Q8TB24	985 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIPEP	Q99797	713 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM260	Q9NX78	707 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIPK3	Q9Y572	518 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf81	C9J6K1	198 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXCL11	O14625	94 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB5	O15062	677 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP1	P03956	469 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	NF2	P35240	595 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNAQ	P50148	359 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FKBP1B	P68106	108 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTRA3	P83110	453 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPAR1	Q92633	364 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	C8orf76	Q96K31	380 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FEZ1	Q99689	392 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BARHL2	Q9NY43	387 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTBD7	Q9P203	1132 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOCK1	Q14185	1865 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTBD19	C9JJ37	291 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	VWA5A	O00534	786 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIS2	O14770	477 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	LEFTY1	O75610	366 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDKL5	O76039	1030 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM70	O94826	608 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	7.03	□□□□□ -1.28	3e-10	■■□□□ 13.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HUNK	P57058	714 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2S	Q16763	222 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC174	Q6PII3	467 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHISA5	Q8N114	240 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28

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