RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ZNF276Q8N554 614 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 NINJ1Q92982 152 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 FERMT2Q96AC1 680 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PRRX2Q99811 253 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 FANCLQ9NW38 375 aa6.36□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 FOXN1O15353 648 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PTGS2P35354 604 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 FSTL1Q12841 308 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PASD1Q8IV76 773 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 HAS1Q92839 578 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 MLST8Q9BVC4 326 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.35□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 PRSS38A1L453 326 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 COL10A1Q03692 680 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 NIM1KQ8IY84 436 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 LENG9Q96B70 501 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 ZG16BQ96DA0 208 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SSB-211ENST00000490914 NRP1O14786 923 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PPFIA2O75334 1257 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PHC1P78364 1004 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GPR158Q5T848 1215 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 VRK3Q8IV63 474 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GAB3Q8WWW8 586 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 APPBP2Q92624 585 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 EPC1Q9H2F5 836 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.33□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 MGAT5Q09328 741 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 TERF2Q15554 542 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 ZNF575Q86XF7 245 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 IL17RAQ96F46 866 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 A0A1W2PR48 441 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 DNAJC6O75061 913 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 TGM1P22735 817 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PPARAQ07869 468 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 XYLT1Q86Y38 959 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 ANO3Q9BYT9 981 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 FZD1Q9UP38 647 aa6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 AHRRA9YTQ3 701 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 ITGB1P05556 798 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PROZP22891 400 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LSP1P33241 339 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LSSP48449 732 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 SCNN1BP51168 640 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 IL2P60568 153 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 SYNE4Q8N205 404 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 GPR150Q8NGU9 434 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.3□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 TRIM24O15164 1050 aa6.29□□□□□ -1.4
SSB-211ENST00000490914 CDC45O75419 566 aa6.29□□□□□ -1.4
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