RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.39□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.39□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ALDH1A2O94788 518 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ASLP04424 464 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 SLC9A1P19634 815 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 SOX7Q9BT81 388 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 MYL10Q9BUA6 226 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.38□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 OPA1O60313 960 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 LPXNO60711 386 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 WNT3AP56704 352 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 C2orf27AQ580R0 203 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 LCORLQ8N3X6 602 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ARMC5Q96C12 935 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 POFUT1Q9H488 388 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.37□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 GAGE12BA1L429 117 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 RAPGEF3O95398 923 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CASRP41180 1078 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 AVPR1BP47901 424 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 PTTG1IPP53801 180 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 FAM189BP81408 668 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 COLEC12Q5KU26 742 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 DOK3Q7L591 496 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 IL17RAQ96F46 866 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 COX11Q9Y6N1 276 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CFBP00751 764 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 RBL2Q08999 1139 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 MKL1Q969V6 931 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CBX4O00257 560 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 NCR1O76036 304 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 FLT3P36888 993 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 GZMKP49863 264 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 COQ10AQ96MF6 247 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 TOMM22Q9NS69 142 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 SYBUQ9NX95 663 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGA4-211ENST00000490435 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PCDH8O95206 1070 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA10O95299 355 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CD69Q07108 199 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF460Q14592 562 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CAVIN3Q969G5 261 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 INSL6Q9Y581 213 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 MYPNQ86TC9 1320 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 LY86O95711 162 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CDK4P11802 303 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 BMPR1AP36894 532 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 DUSP2Q05923 314 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 SOGA3Q5TF21 947 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 DIRC3C9JPN6 131 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 HKR1P10072 659 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms