RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489838.5

WDR48-210, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 3

Gene WDR48, Length 360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-210ENST00000489838 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.86□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.86□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 ORAI2Q96SN7 254 aa6.86□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.86□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 DPP7Q9UHL4 492 aa6.86□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 K7ESF4 209 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 MTSS1O43312 755 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 ALDH1A2O94788 518 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 GUCY2FP51841 1108 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 IL23AQ9NPF7 189 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 ING3Q9NXR8 418 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 NCDNQ9UBB6 729 aa6.85□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 A0A1W2PR48 441 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 NRP1O14786 923 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 GPR3P46089 330 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 SELENOPP49908 381 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 CDK17Q00537 523 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 FOXL1Q12952 345 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 PTPROQ16827 1216 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 TCF25Q9BQ70 676 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 MENTQ9BUN1 341 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 KLC2Q9H0B6 622 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.84□□□□□ -1.31
WDR48-210ENST00000489838 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 UBE2QL1A1L167 161 aa6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 ALG1L2C9J202 215 aa6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 NPEPPSP55786 919 aa6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 HHEXQ03014 270 aa6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 TOR2AQ5JU69 321 aa6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 PRAMEF4O60810 478 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 EVA1CP58658 441 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 ITKQ08881 620 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 UBE3CQ15386 1083 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 MUM1Q2TAK8 710 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 KCNK18Q7Z418 384 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SPRED1Q7Z699 444 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 D2HGDHQ8N465 521 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 ARL8AQ96BM9 186 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 FAM89AQ96GI7 184 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 ADOQ96SZ5 270 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.82□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 MUSKO15146 869 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 WNT3AP56704 352 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 DUSP2Q05923 314 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 PALM2Q8IXS6 379 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 TSPEARQ8WU66 669 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 EDAQ92838 391 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 FATE1Q969F0 183 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.81□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 TMEM127O75204 238 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 KATNA1O75449 491 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 C6P13671 934 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 CTSSP25774 331 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SLC5A3P53794 718 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 MTMR1Q13613 665 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 ANO4Q32M45 955 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 Q6ZSN1 163 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 SNX33Q8WV41 574 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 MTMR8Q96EF0 704 aa6.8□□□□□ -1.32
WDR48-210ENST00000489838 GPATCH3Q96I76 525 aa6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms