RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD62A6NC57 917 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 GH1P01241 217 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ALADP13716 330 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 RPA1P27694 616 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 COPS2P61201 443 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 MESDQ14696 234 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 NUGGCQ68CJ6 796 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CD209Q9NNX6 404 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 RGL1Q9NZL6 768 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.02□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PYGMP11217 842 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 COMTP21964 271 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CTNNA2P26232 953 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGAP4P98171 946 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 BNIP1Q12981 228 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 VSTM1Q6UX27 236 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FITM2Q8N6M3 262 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ERMNQ8TAM6 284 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SPDL1Q96EA4 605 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FAM86B1E9PN63 330 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SUN1O94901 812 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ALAS1P13196 640 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RARGP13631 454 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GPSM2P81274 684 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GABPAQ06546 454 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MPP2Q14168 576 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MYCT1Q8N699 235 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 RDH13Q8NBN7 331 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ART4Q93070 314 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 LENG9Q96B70 501 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 BTBD6Q96KE9 485 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 AGPAT1Q99943 283 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.02□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PODXLO00592 558 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ZBTB39O15060 712 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 UFL1O94874 794 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CYP3A7P24462 503 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ADCY1Q08828 1119 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SLMAPQ14BN4 828 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 TNIP1Q15025 636 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MFSD5Q6N075 450 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 SPATA21Q7Z572 469 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MBOAT7Q96N66 472 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 PARP2Q9UGN5 583 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 EML1O00423 815 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MEIS2O14770 477 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 GCKP35557 465 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 CHKAP35790 457 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 MSH2P43246 934 aa11.01□□□□□ -0.65
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF131P52739 623 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms