RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 FIGNQ5HY92 759 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 LINC01465Q8N7H1 131 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 TMX1Q9H3N1 280 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 SPC25Q9HBM1 224 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 CAPN11Q9UMQ6 739 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXB3-210ENST00000489475 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
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HOXB3-210ENST00000489475 AKT3Q9Y243 479 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXB3-210ENST00000489475 NRCAMQ92823 1304 aa29.26■■■□□ 2.27
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HOXB3-210ENST00000489475 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa29.25■■■□□ 2.27
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HOXB3-210ENST00000489475 ERO1AQ96HE7 468 aa29.25■■■□□ 2.27
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HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA8JA6NMD2 632 aa29.24■■■□□ 2.27
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HOXB3-210ENST00000489475 RAET1EQ8TD07 263 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXB3-210ENST00000489475 LMBR1Q8WVP7 490 aa29.24■■■□□ 2.27
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HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQJ5 194 aa29.23■■■□□ 2.27
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HOXB3-210ENST00000489475 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
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HOXB3-210ENST00000489475 PGK1P00558 417 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM49P0CI25 452 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM49CP0CI26 452 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXB3-210ENST00000489475 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
HOXB3-210ENST00000489475 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.272e-7■■□□□ 14.4
HOXB3-210ENST00000489475 GBP6Q6ZN66 633 aa29.2■■■□□ 2.27
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