RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 NCK2O43639 380 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 PTPAQ15257 358 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 ZNF558Q96NG5 402 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 CLIC4Q9Y696 253 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 BRWD1Q9NSI6 2320 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa26.91■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 A0A1B0GUA9 196 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 GUCY2CP25092 1073 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 KCNK18Q7Z418 384 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 THNSL1Q8IYQ7 743 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 BSNDQ8WZ55 320 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 HLA-CQ95604 372 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 LZTS1Q9Y250 596 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 OFD1O75665 1012 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 PLCB3Q01970 1234 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 URGCPQ8TCY9 931 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 LPPQ93052 612 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 CPB2Q96IY4 423 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 RSAD1Q9HA92 442 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
EHD1-211ENST00000489379 ACKR2O00590 384 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 FGF18O76093 207 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 ITGA4P13612 1032 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 POF1BQ8WVV4 589 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 IPPQ9Y573 584 aa26.88■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 N4BP3O15049 544 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 HIP1RO75146 1068 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 PRKCBP05771 671 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 PLA2G4BP0C869 781 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 SLC12A3P55017 1021 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 KRT17Q04695 432 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 SLC39A14Q15043 492 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TJAP1Q5JTD0 557 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 SPG21Q9NZD8 308 aa26.87■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 ASB2Q96Q27 587 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 PLIN2Q99541 437 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TMEM134Q9H6X4 195 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 HCSTQ9UBK5 93 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.86■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 K7ERI5 159 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 INPPL1O15357 1258 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 B4GALT5O43286 388 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TXLNAP40222 546 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 CAMK1Q14012 370 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 DAW1Q8N136 415 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 USP28Q96RU2 1077 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 TLR9Q9NR96 1032 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa26.85■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.84■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 FSD2A1L4K1 749 aa26.84■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 CCDC169A6NNP5 214 aa26.84■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.84■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
EHD1-211ENST00000489379 NPTX2P47972 431 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms