RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487667.5

PHF1-209, Transcript of PHD finger protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF1, Length 1,930 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1-209ENST00000487667 TUBB2AQ13885 445 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 PLCB4Q15147 1175 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 ASIC2Q16515 512 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.17■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 MCM3APO60318 1980 aa22.17■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 SOX10P56693 466 aa22.16■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.16■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 GPD1LQ8N335 351 aa22.16■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.16■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 ADSSP30520 456 aa22.16■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 TRPC6Q9Y210 931 aa22.16■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 USP20Q9Y2K6 914 aa22.15■■□□□ 1.14
PHF1-209ENST00000487667 COL1A2P08123 1366 aa22.15■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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PHF1-209ENST00000487667 STAT1P42224 750 aa22.14■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 MAP2K5Q13163 448 aa22.14■■□□□ 1.13
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PHF1-209ENST00000487667 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.14■■□□□ 1.13
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PHF1-209ENST00000487667 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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PHF1-209ENST00000487667 ZNF233A6NK53 670 aa22.13■■□□□ 1.13
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PHF1-209ENST00000487667 TRIM49P0CI25 452 aa22.13■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 TRIM49CP0CI26 452 aa22.13■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 ARHGAP25P42331 645 aa22.13■■□□□ 1.13
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PHF1-209ENST00000487667 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 MORN1Q5T089 497 aa22.13■■□□□ 1.13
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PHF1-209ENST00000487667 IFNL1Q8IU54 200 aa22.13■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.13■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 SIP14410 1827 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 TLR2O60603 784 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 GFPT2O94808 682 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 LGALS2P05162 132 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 ACTN1P12814 892 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 MARK3P27448 753 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 MXI1P50539 228 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 CAPSQ13938 189 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 CBWD6Q4V339 395 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.12■■□□□ 1.13
PHF1-209ENST00000487667 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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