RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF592Q92610 1267 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MAML3Q96JK9 1138 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KATNBL1Q9H079 304 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GCNT4Q9P109 453 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GABRQQ9UN88 632 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.32□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MCM3APO60318 1980 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM49P0CI25 452 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM49CP0CI26 452 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PON1P27169 355 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 VAMP7P51809 220 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT83P78385 493 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MYL7Q01449 175 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 STRN3Q13033 797 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MORN1Q5T089 497 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 IER5Q5VY09 327 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PPTC7Q8NI37 304 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TCP11Q8WWU5 503 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 BICD1Q96G01 975 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TINF2Q9BSI4 451 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO6Q9UM54 1294 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPC6Q9Y210 931 aa11.31□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 HBP1O60381 514 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ACTN1P12814 892 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC9A1P19634 815 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GARTP22102 1010 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CNGA1P29973 690 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ADSSP30520 456 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ADCYAP1R1P41586 468 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 LIG4P49917 911 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP2K5Q13163 448 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MTFR1Q15390 333 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ASIC2Q16515 512 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 RDH13Q8NBN7 331 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC42Q96M95 316 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 P4HA2O15460 535 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ADCY3O60266 1144 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF5CO60282 957 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 PIGRP01833 764 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SERPING1P05155 500 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 LGALS2P05162 132 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ADRB2P07550 413 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 UCHL3P15374 230 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GRK4P32298 578 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 GNG11P61952 73 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 APBA1Q02410 837 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ENPEPQ07075 957 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CETN1Q12798 172 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 IRF5Q13568 498 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 ACVR2BQ13705 512 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 CAPSQ13938 189 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SPA17Q15506 151 aa11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTPBP1-211ENST00000487538 DUSP28Q4G0W2 176 aa11.29□□□□□ -0.6
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