RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
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RABGEF1-207ENST00000484547 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.18□□□□□ -0.3
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RABGEF1-207ENST00000484547 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.18□□□□□ -0.3
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RABGEF1-207ENST00000484547 MIER3Q7Z3K6 550 aa13.18□□□□□ -0.3
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RABGEF1-207ENST00000484547 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-207ENST00000484547 RSAD1Q9HA92 442 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-207ENST00000484547 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-207ENST00000484547 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-207ENST00000484547 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-207ENST00000484547 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RABGEF1-207ENST00000484547 ACACBO00763 2458 aa13.13□□□□□ -0.31
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