RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CYP27B1O15528 508 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PTGS1P23219 599 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CSF2RBP32927 897 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZXDAP98168 799 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SLFN13Q68D06 897 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 AJUBAQ96IF1 538 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 NCAPD2Q15021 1401 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ESYT3A0FGR9 886 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 EXOC5O00471 708 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SCDO00767 359 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PHKG2P15735 406 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF20P17024 532 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MC4RP32245 332 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 RRADP55042 308 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 DDB1Q16531 1140 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf27AQ580R0 203 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 BRAPQ7Z569 592 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 IL17REQ8NFR9 667 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN18Q99952 460 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 INCENPQ9NQS7 918 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ATRNO75882 1429 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 GLI3P10071 1580 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 GPR42O15529 346 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CUTAO60888 179 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 AOAHP28039 575 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 POLD1P28340 1107 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ICAM4Q14773 271 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 WDR48Q8TAF3 677 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KATNBL1Q9H079 304 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 DISP2A7MBM2 1401 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K5Q99683 1374 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 HIP1RO75146 1068 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY8P40145 1251 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 HERVK_113P62684 666 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 LMF1Q96S06 567 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 DEF6Q9H4E7 631 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF521Q96K83 1311 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KCNQ3O43525 872 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MMEP08473 750 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 IL13RA1P78552 427 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SLC39A6Q13433 755 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 JMYQ8N9B5 988 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 HIPK4Q8NE63 616 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 GALNT8Q9NY28 637 aa6.04□□□□□ -1.44
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