RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474707.1

RABGAP1-208, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, human

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGAP1-208	ENST00000474707	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	GAA	P10253	952 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	PTH2R	P49190	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	EPHA7	Q15375	998 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	DOK3	Q7L591	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	NELL1	Q92832	810 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	FSBP	O95073	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CYP17A1	P05093	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	HKR1	P10072	659 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CTGF	P29279	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	BMPR1A	P36894	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	NME9	Q86XW9	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	LEFTY2	O00292	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	OPHN1	O60890	802 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	NDUFA10	O95299	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	WNT3A	P56704	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707		M0R2C6	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	C1R	P00736	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CXCR5	P32302	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	CASR	P41180	1078 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGAP1-208	ENST00000474707	MAFG	O15525	162 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PLA2G5	P39877	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	FOXF2	Q12947	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	GPR162	Q16538	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ADAM2	Q99965	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707		H7C1D1	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ESRRB	O95718	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	GZMK	P49863	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	NHLH2	Q02577	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	CD69	Q07108	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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