RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ERVFC1P60507 584 aa26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP5-208ENST00000459627 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5-208ENST00000459627 BRAPQ7Z569 592 aa26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP5-208ENST00000459627 DNM3Q9UQ16 869 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP5-208ENST00000459627 CLIC4Q9Y696 253 aa26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.46■■□□□ 1.83
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SH3BP5-208ENST00000459627 PGBD4Q96DM1 585 aa26.45■■□□□ 1.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.45■■□□□ 1.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF280BQ86YH2 543 aa26.44■■□□□ 1.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 SFI1A8K8P3 1242 aa26.42■■□□□ 1.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 GAD1Q99259 594 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC28Q96AY4 2481 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-208ENST00000459627 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.4■■□□□ 1.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 PEX3P56589 373 aa26.4■■□□□ 1.82
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