RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 BORCS6Q96GS4 357 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP7D2Q96T17 732 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 B4GALT5O43286 388 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SEZ6Q53EL9 994 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM84AQ96KN4 292 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 MAGEB2O15479 319 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 ASGR1P07306 291 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM49P0CI25 452 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM49CP0CI26 452 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GRK4P32298 578 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 DLG4P78352 724 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 STRN3Q13033 797 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SYCP1Q15431 976 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 COL1A2P08123 1366 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 LIG4P49917 911 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 RBL2Q08999 1139 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SIP14410 1827 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 NRCAMQ92823 1304 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 MSCO60682 206 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 ADRB2P07550 413 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 FGFR4P22455 802 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNH2Q12809 1159 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 KIZQ2M2Z5 673 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 WBP1LQ9NX94 342 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GNA14O95837 355 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAM17P78536 824 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 NFIL3Q16649 462 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SPC25Q9HBM1 224 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 EPHB6O15197 1021 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GNRH1P01148 92 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP2C9P11712 490 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 C7orf31Q8N865 590 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC35C1Q96A29 364 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 HVCN1Q96D96 273 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 GYPCP04921 128 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 TMOD1P28289 359 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 CASP14P31944 242 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 PTENP60484 403 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB33Q86T24 672 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 NLRP7Q8WX94 980 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-204ENST00000452765 PRKCBP05771 671 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNMA1Q12791 1236 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 ACOT2P49753 483 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms