RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439504.6

ATG16L2-203, Transcript of autophagy related 16 like 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG16L2, Length 3,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2-203ENST00000439504 C7orf31Q8N865 590 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 EXOC4Q96A65 974 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 LRRC45Q96CN5 670 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ZWILCHQ9H900 591 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MYH8P13535 1937 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ANO9A1A5B4 782 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ENTPD3O75355 529 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MMEP08473 750 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 CNGA1P29973 690 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 MARCKSL1P49006 195 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 ELP3Q9H9T3 547 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 TMX2Q9Y320 296 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG16L2-203ENST00000439504 WDR64B1ANS9 1081 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 MYO1CO00159 1063 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 WEE2P0C1S8 567 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 NR1D1P20393 614 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ERFP50548 548 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PPATQ06203 517 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 NAB2Q15742 525 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 UGCGQ16739 394 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 COL20A1Q9P218 1284 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TSKSQ9UJT2 592 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ALG6Q9Y672 507 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 HOOK3Q86VS8 718 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 MFAP3P55082 362 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PPP3CAQ08209 521 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 FMO2Q99518 471 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 NOL4O94818 638 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 VCAM1P19320 739 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 COMTP21964 271 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 AGPAT1Q99943 283 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 SNED1Q8TER0 1413 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 GRAP2O75791 330 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TUBB4BP68371 445 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 DCAF15Q66K64 600 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 KRT35Q92764 455 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 C18orf8Q96DM3 657 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 LAMA4Q16363 1823 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 LRRD1A4D1F6 860 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 GJB1P08034 283 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 COL4A1P02462 1669 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ZNF233A6NK53 670 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TGFB1I1O43294 461 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 KRT15P19012 456 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 AMPD2Q01433 879 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 MEA1Q16626 185 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 AKT3Q9Y243 479 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 NR2E1Q9Y466 385 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 YY1P25490 414 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PSMC4P43686 418 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 C9orf72Q96LT7 481 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PLVAPQ9BX97 442 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 CCND2P30279 289 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 PSMC5P62195 406 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG16L2-203ENST00000439504 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms