RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 CREG2Q8IUH2 290 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 MGARPQ8TDB4 240 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PQJ5 194 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TTI1O43156 1089 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ORC1Q13415 861 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT71Q3SY84 523 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 NT5C1BQ96P26 610 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 AZI2Q9H6S1 392 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PCNTO95613 3336 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 RARRES1P49788 294 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PSMC5P62195 406 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 AMPD2Q01433 879 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CTNNA2P26232 953 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXD13P35453 343 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP3CAQ08209 521 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 K7ERI5 159 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 HGSNATQ68CP4 663 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ANO9A1A5B4 782 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.079e-7■□□□□ 10
RABGEF1-210ENST00000437078 CNGA1P29973 690 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CCT5P48643 541 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PDE6CP51160 858 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKCEQ02156 737 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PGM5Q15124 567 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 NAB2Q15742 525 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 Q3C1V9 767 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF181Q9P0P0 153 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ADM5C9JUS6 153 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 GJB6O95452 261 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 OPA1O60313 960 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 IFNB1P01574 187 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SETSIPP0DME0 302 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 LMNB1P20700 586 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM270Q6UE05 265 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC5A5Q92911 643 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TATDN2Q93075 761 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 APOL6Q9BWW8 343 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 NPTX2P47972 431 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 IQCDQ96DY2 449 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM206Q9H813 350 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SATB1Q01826 763 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 VWA5AO00534 786 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms