RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HLA-B-250ENST00000434333 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.41■■□□□ 1.18
HLA-B-250ENST00000434333 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.4■■□□□ 1.18
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.4■■□□□ 1.18
HLA-B-250ENST00000434333 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.4■■□□□ 1.18
HLA-B-250ENST00000434333 A0A087WWV3 80 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 TSPAN1O60635 241 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 DGAT1O75907 488 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 DDHD2O94830 711 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ARL2P36404 184 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 SLC11A1P49279 550 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CAPSQ13938 189 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 AMHR2Q16671 573 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 VPS52Q8N1B4 723 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 RSAD1Q9HA92 442 aa22.39■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 GLRA2P23416 452 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 MCM7P33993 719 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 POU5F1BQ06416 359 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 APOL5Q9BWW9 433 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 GBP3Q9H0R5 595 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 IRAK3Q9Y616 596 aa22.38■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CARNS1A5YM72 827 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ERLIN2O94905 339 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CXCL14O95715 111 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CTSAP10619 480 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ATP2B1P20020 1258 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 C8orf34Q49A92 452 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 URGCPQ8TCY9 931 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CASP10Q92851 521 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 C8orf76Q96K31 380 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CDH22Q9UJ99 828 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 IPPQ9Y573 584 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 TECTAO75443 2155 aa22.37■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 MED24O75448 989 aa22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 AXLP30530 894 aa22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 TFDP1Q14186 410 aa22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CPB2Q96IY4 423 aa22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 RNF39Q9H2S5 420 aa22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 INPPL1O15357 1258 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 POMCP01189 267 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 NOTUMQ6P988 496 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CNNM3Q8NE01 707 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 EDAQ92838 391 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 FAM122AQ96E09 287 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC51Q96ER9 411 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CSRNP2Q9H175 543 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.35■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ITGA4P13612 1032 aa22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 PTPN14Q15678 1187 aa22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF174Q15697 407 aa22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 HES2Q9Y543 173 aa22.34■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 NRP1O14786 923 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 B4GALT5O43286 388 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 OR52Z1P0C646 297 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CA8P35219 290 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 MARCH5Q9NX47 278 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 MIOSQ9NXC5 875 aa22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HLA-B-250ENST00000434333 ARL5CA6NH57 179 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 EPCAMP16422 314 aa22.32■■□□□ 1.16
HLA-B-250ENST00000434333 MLH1P40692 756 aa22.32■■□□□ 1.16
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