RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSANTD3Q96H12 275 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RMDN3Q96TC7 470 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOTCH4Q99466 2003 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEX28O15482 410 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMYND10O75800 440 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYF5P13349 255 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDE6AP16499 860 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTR9Q6PD62 1173 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLCO6A1Q86UG4 719 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC9Q92623 222 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IRF7Q92985 503 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POM121Q96HA1 1249 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM117AQ9C073 453 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARMT1Q9H993 441 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL20A1Q9P218 1284 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEPT3Q9UH03 358 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCLK1O15075 740 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPS6KA5O75582 802 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NR3C2P08235 984 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NTHL1P78549 312 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DSC3Q14574 896 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAPK6Q16659 721 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLRX5Q86SX6 157 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITFG1Q8TB96 612 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMYM6O95789 1325 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPG11Q96JI7 2443 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OPHN1O60890 802 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C8AP07357 584 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TLE3Q04726 772 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BAP1Q92560 729 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CENPEQ02224 2701 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GALTP07902 379 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDUFV2P19404 249 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNFRSF8P28908 595 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT76Q01546 638 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNNI3KQ59H18 835 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C11orf74Q86VG3 221 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR182O15218 404 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA31D3P0C874 917 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WWC1Q8IX03 1113 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYH7P12883 1935 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCB11O95342 1321 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRCP08575 1304 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BLACEA4D250 179 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRGAP3O43295 1099 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms