RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 RUFY1Q96T51 708 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 AGPAT1Q99943 283 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 NFASCO94856 1347 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ANKRD62A6NC57 917 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 H0YCG3 227 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ATP2A1O14983 1001 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 HSF2BPO75031 334 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 PHACTR2O75167 634 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GGCXP38435 758 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GCLMP48507 274 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GUCY2DQ02846 1103 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 PPP3CAQ08209 521 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 PFASO15067 1338 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 MYPNQ86TC9 1320 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TMEM150BA6NC51 233 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TISP43B9A030 160 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 LRRN2O75325 713 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GLI1P08151 1106 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 NPTX2P47972 431 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 HMGCS2P54868 508 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ENPEPQ07075 957 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GNPTABQ3T906 1256 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ANO5Q75V66 913 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 METTL13Q8N6R0 699 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 WHAMMQ8TF30 809 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SCFD2Q8WU76 684 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 HES6Q96HZ4 224 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 CEP170P1Q96L14 293 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ACAD9Q9H845 621 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 RIPK3Q9Y572 518 aa14.81□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 DGAT1O75907 488 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 KCNA2P16389 499 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 MFAP3P55082 362 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 RTP1P59025 263 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 WNK4Q96J92 1243 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ARID2Q68CP9 1835 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 RLFQ13129 1914 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 DENND3A2RUS2 1198 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ABCB4P21439 1286 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GTF2H1P32780 548 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 PPFIA1Q13136 1202 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 CUL1Q13616 776 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 KRT39Q6A163 491 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 MREGQ8N565 214 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TMC2Q8TDI7 906 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 AGPSO00116 658 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 KRIT1O00522 736 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 RAD51CO43502 376 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ADRB2P07550 413 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 CAPN2P17655 700 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SCP2P22307 547 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 CNGA1P29973 690 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms