RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 KLRC1P26715 233 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SOX5P35711 763 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 FAM170AA1A519 330 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 MROH8Q9H579 483 aa25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
FAAP20-209ENST00000428120 ANO9A1A5B4 782 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CTAGE8P0CG41 777 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GLRA2P23416 452 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 MXI1P50539 228 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CTAGE6Q86UF2 777 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CTAGE4Q8IX94 777 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 COPS5Q92905 334 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NOX5Q96PH1 765 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 ALS2CR12Q96Q35 445 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CEP89Q96ST8 783 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 JRKLQ9Y4A0 524 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 FERP16591 822 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 COPB2P35606 906 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 RABGGTAQ92696 567 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GLG1Q92896 1179 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 PSMB7Q99436 277 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NAGPAQ9UK23 515 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK13O15264 365 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NCK2O43639 380 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CLCN6P51797 869 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CETN1Q12798 172 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 EPC2Q52LR7 807 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 FAM84AQ96KN4 292 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 MMS19Q96T76 1030 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 PDHXO00330 501 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 DRP2Q13474 957 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NAB2Q15742 525 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 AZI2Q9H6S1 392 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GPR20Q99678 358 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA3Q9UL41 463 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.622e-8■■■■□ 23.1
FAAP20-209ENST00000428120 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 LIG4P49917 911 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.622e-8■■■□□ 15.2
FAAP20-209ENST00000428120 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 ARL2P36404 184 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CCL15Q16663 113 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 DEPTORQ8TB45 409 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 KAT5Q92993 513 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 BTBD19C9JJ37 291 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GRIN3BO60391 1043 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CXCR5P32302 372 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 FBXL18Q96ME1 805 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA33Q96N06 139 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 SNX12Q9UMY4 172 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 PALMO75781 387 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 CYP24A1Q07973 514 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 STRN3Q13033 797 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 VPS36Q86VN1 386 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GPD1LQ8N335 351 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA4DQ92854 862 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-209ENST00000428120 P4HA2O15460 535 aa25.15■■□□□ 1.62
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