RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR149Q86SP6 731 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSAD1Q9HA92 442 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAV3Q9UKW4 847 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPLX1O14810 134 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDHD2O94830 711 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REC8O95072 547 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCN4P51793 760 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPEPPSP55786 919 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R5CQ13362 524 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INF2Q27J81 1249 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUFY3Q7L099 469 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPME1Q9Y570 386 aa14.74□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLRC2P26717 231 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBL1P41271 181 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LETM2Q2VYF4 491 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBXN11Q5T124 520 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP170P1Q96L14 293 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIFM3Q96NN9 605 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LILRB3O75022 631 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOD2P04179 222 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFC5P40937 340 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCN5P51795 746 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM143Q96AN5 459 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LXNQ9BS40 222 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.72□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR23AA6NEV1 266 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRP1O14786 923 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POMCP01189 267 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH2P05091 517 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 URODP06132 367 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDGQ13569 410 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMC2Q15006 297 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEK8Q86SG6 692 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLCNQ8NFG4 579 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM20AQ96MK3 541 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARCH5Q9NX47 278 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.71□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK3Q13188 491 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FERMT3Q86UX7 667 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf19Q8IY42 314 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF149Q8NC42 400 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNNM3Q8NE01 707 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCP11Q8WWU5 503 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms