RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	GLP2R	O95838	553 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	MUT	P22033	750 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	GJB2	P29033	226 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	PDIA5	Q14554	519 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	MBTPS2	O43462	519 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	AMHR2	Q16671	573 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	DUSP6	Q16828	381 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	MCTP1	Q6DN14	999 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	GJD3	Q8N144	294 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	CPB2	Q96IY4	423 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	RSAD1	Q9HA92	442 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	ECM1	Q16610	540 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	NOTUM	Q6P988	496 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	PADI6	Q6TGC4	694 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	CNNM3	Q8NE01	707 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC51	Q96ER9	411 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CIZ1-209	ENST00000420484	HIDE1	A8MVS5	230 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	TMC7	Q7Z402	723 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	URGCP	Q8TCY9	931 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	32.94	■■■□□ 2.86	1e-8	■■□□□ 12.3
CIZ1-209	ENST00000420484	CSRNP2	Q9H175	543 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	IPP	Q9Y573	584 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	C5orf42	Q9H799	3197 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	FSD2	A1L4K1	749 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	LAD1	O00515	517 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	GALT	P07902	379 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	COASY	Q13057	564 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM169	Q96HH4	297 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	GBP3	Q9H0R5	595 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	CARNS1	A5YM72	827 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	EYA4	O95677	639 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	ITGA4	P13612	1032 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	CYP11B2	P19099	503 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	RAB34	Q9BZG1	259 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484		H3BQV1	296 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	B4GALT5	O43286	388 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	B4GALT3	O60512	393 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	PRPH	P41219	470 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	ZP2	Q05996	745 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	IL17A	Q16552	155 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	IGSF21	Q96ID5	467 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	RNF39	Q9H2S5	420 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	STK24	Q9Y6E0	443 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	DDHD2	O94830	711 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC11A1	P49279	550 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	KCNC3	Q14003	757 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	BSND	Q8WZ55	320 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	HES2	Q9Y543	173 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	POMC	P01189	267 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CIZ1-209	ENST00000420484		A0A1B0GUA9	196 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIZ1-209	ENST00000420484	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		32.88	■■■□□ 2.85

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms