RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419348.6

HTATIP2-201, Transcript of HIV-1 Tat interactive protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HTATIP2, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATIP2-201ENST00000419348 PTPRSQ13332 1948 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 TSPAN1O60635 241 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 SMTNP53814 917 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 DHX58Q96C10 678 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 CUL9Q8IWT3 2517 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.21■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 A0A1W2PQ27 194 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 A0A1W2PQ64 194 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 A0A1W2PQD8 194 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 K7ERI5 159 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM13AO94988 1023 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 SKIP12755 728 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF131P52739 623 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 DDX12PQ92771 950 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC51Q96ER9 411 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 YME1L1Q96TA2 773 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 PARVGQ9HBI0 331 aa24.2■■□□□ 1.47
HTATIP2-201ENST00000419348 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 MYMKA6NI61 221 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 DGKIO75912 1065 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 EOMESO95936 686 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 NOTUMQ6P988 496 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 TNMDQ9H2S6 317 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ACKR2O00590 384 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF623O75123 536 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 PRKCBP05771 671 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 RAB27AP51159 221 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 AMPD3Q01432 767 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 DYMQ7RTS9 669 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 MYCT1Q8N699 235 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 A0A1B0GVL5 298 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 H0YCG3 227 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 SLC16A4O15374 487 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 B4GALT5O43286 388 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 PFKFB1P16118 471 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 CPB2Q96IY4 423 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 HPSEQ9Y251 543 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 MYO9BQ13459 2157 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 A0A1B0GUA9 196 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 LIG1P18858 919 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 SCP2P22307 547 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 TAP1Q03518 808 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 CERS4Q9HA82 394 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 USP25Q9UHP3 1055 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 LCHNA4D1U4 455 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 HOXA2O43364 376 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 NCKAP1LP55160 1127 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 UBXN11Q5T124 520 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 KCNN1Q92952 543 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 GBF1Q92538 1859 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 MYH11P35749 1972 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 TRAK2O60296 914 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 SLFN14P0C7P3 912 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 GAP43P17677 238 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 FSIP1Q8NA03 581 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 CNNM3Q8NE01 707 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 STAMQ92783 540 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 PGBD4Q96DM1 585 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 LINC01553A4QN01 128 aa24.14■■□□□ 1.46
HTATIP2-201ENST00000419348 RFXAPO00287 272 aa24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms